Ấn Độ được coi là một trong những đối tác quan trọng của Việt Nam trong lĩnh vực khoa học-công nghệ. Ngoài Tiểu ban về Hợp tác Khoa học-Công nghệ, Việt Nam và Ấn Độ cũng đã kí Nghị định thư Công nghệ thông tin (CNTT) đầu tiên vào năm 1999. Phía Việt Nam đã nhận được sự hỗ trợ khá hiệu quả trong một số dự án CNTT, bao gồm cả dự án Viện trợ Phát triển Nguồn nhân lực cho ngành công nghiệp phần mềm và một dự án khác nhằm thiết lập Trung tâm Lao động có trình độ ở Hà Nội. Bên cạnh đó, hai nước cũng đã hợp tác tốt đẹp trong các lĩnh vực công nghệ cao như năng lượng hạt nhân vì mục đích hòa bình, công nghệ sinh học (lai tạo giống). Dưới đây là các Viện nghiên cứu hàng đầu của Ấn Độ trong lĩnh vực Khoa học và Công nghệ: